Микробиом кишечника методом NGS (Next Generation Sequencing/ секвенирование нового поколения), количественное определение

Это современное исследование состава микробиоты кишечника методом секвенирования нового поколения (NGS, Next Generation Sequencing). В отличие от обычного посева, который выявляет лишь небольшую часть культивируемых бактерий, NGS анализирует генетический материал микроорганизмов и позволяет оценить микрофлору значительно полнее, включая бактерии, не растущие на питательных средах.

Исследование показывает разнообразие и соотношение основных групп микроорганизмов, позволяет выявить дисбаланс микробиоты (уменьшение полезных бактерий, чрезмерный рост других групп), оценить общее разнообразие микрофлоры. Состояние микробиоты связывают с пищеварением, иммунитетом, обменом веществ, а нарушение её баланса, с рядом заболеваний пищеварительной системы и не только.

Анализ применяют при хронических расстройствах пищеварения, после длительного приёма антибиотиков, для индивидуального подбора питания и коррекции микрофлоры. Важно понимать, что микробиом очень индивидуален и меняется под влиянием питания и образа жизни, поэтому результат не является диагнозом сам по себе. Его обязательно интерпретирует врач в сочетании с жалобами и клинической картиной.

Подготовка направлена на то, чтобы результат отражал обычное состояние микрофлоры.

• За несколько недель до исследования по согласованию с врачом желательно завершить приём антибиотиков, поскольку они существенно меняют состав микробиоты; оптимальный интервал уточните у врача или лаборатории.
• За несколько дней до сбора желательно не принимать пробиотики, пребиотики и сорбенты, если иное не рекомендовал врач.
• Придерживайтесь привычного рациона, чтобы результат отражал ваше типичное состояние микрофлоры.
• Не используйте слабительные средства и клизмы перед сбором материала.
• Собирайте кал в специальный контейнер (часто с транспортной средой) согласно инструкции набора, без примесей мочи и воды.
• Соблюдайте условия хранения и доставки, указанные лабораторией, поскольку для секвенирования важно качество образца.

Исследование предоставляет развёрнутый профиль состава и разнообразия кишечной микробиоты, а не одно числовое значение. Понятие нормы для микробиома условно, поскольку состав микрофлоры очень индивидуален и зависит от питания, возраста, образа жизни и других факторов. Результат подаётся в виде отчёта с оценкой соотношения групп микроорганизмов и их разнообразия. Конкретные референсные диапазоны определяются методикой лаборатории, а толкование обязательно проводит врач с учётом клинической картины.