Мікробіом кишечника методом NGS (Next Generation Sequencing/ секвенування нового покоління), кількісне визначення

Це сучасне дослідження складу мікробіоти кишечника методом секвенування нового покоління (NGS, Next Generation Sequencing). На відміну від звичайного посіву, який виявляє лише невелику частину культивованих бактерій, NGS аналізує генетичний матеріал мікроорганізмів і дозволяє оцінити мікрофлору значно повніше, включно з бактеріями, що не ростуть на поживних середовищах.

Дослідження показує різноманіття та співвідношення основних груп мікроорганізмів, дозволяє виявити дисбаланс мікробіоти (зменшення корисних бактерій, надмірне зростання інших груп), оцінити загальне різноманіття мікрофлори. Стан мікробіоти пов'язують із травленням, імунітетом, обміном речовин, а порушення її балансу, з низкою захворювань травної системи та не тільки.

Аналіз застосовують при хронічних розладах травлення, після тривалого прийому антибіотиків, для індивідуального підбору харчування та корекції мікрофлори. Важливо розуміти, що мікробіом дуже індивідуальний і змінюється під впливом харчування та способу життя, тому результат не є діагнозом сам по собі. Його обов'язково інтерпретує лікар у поєднанні зі скаргами та клінічною картиною.

Підготовка спрямована на те, щоб результат відображав звичайний стан мікрофлори.

• За кілька тижнів до дослідження за погодженням з лікарем бажано завершити прийом антибіотиків, оскільки вони суттєво змінюють склад мікробіоти; оптимальний інтервал уточніть у лікаря або лабораторії.
• За кілька днів до збору бажано не приймати пробіотики, пребіотики та сорбенти, якщо інше не рекомендував лікар.
• Дотримуйтеся звичного раціону, щоб результат відображав ваш типовий стан мікрофлори.
• Не використовуйте проносні засоби та клізми перед збором матеріалу.
• Збирайте кал у спеціальний контейнер (часто із транспортним середовищем) згідно з інструкцією набору, без домішок сечі та води.
• Дотримуйтесь умов зберігання та доставки, зазначених лабораторією, оскільки для секвенування важлива якість зразка.

Дослідження надає розгорнутий профіль складу та різноманіття кишкової мікробіоти, а не одне числове значення. Поняття норми для мікробіому умовне, оскільки склад мікрофлори дуже індивідуальний і залежить від харчування, віку, способу життя та інших факторів. Результат подається у вигляді звіту з оцінкою співвідношення груп мікроорганізмів та їх різноманіття. Конкретні референсні діапазони визначаються методикою лабораторії, а тлумачення обов'язково проводить лікар з урахуванням клінічної картини.